MiSeq システム デスクトップ型の次世代シーケンサー

MiSeq

®

デスクトップ型の次世代シーケンサー

使ってみたらこんなに簡単。世界に挑戦する私のパートナー。 ▶ 最短 8 時間で DNA からデータ解析 ▶ 世界シェア No.1 のテクノロジー ▶ 圧倒的なコストパフォーマンス

最短 8 時間で DNA からデータ解析 MiSeq システムは革新的な一体型システムデザインにより、抜群の使いやすさを誇ります。これまでの次世代シーケンサー は DNA 増幅からシーケンス、データ解析のワークフローは別々の装置で行っていましたが、MiSeq では一連のステップの 自動化に成功しました。わずか 15 分のハンズオンでランが開始でき、データ解析まで自動で行います。 2 時間で終了する

Nextera サンプル調製キットを組み合わせれば、DNA からデータ解析まで最短 8 時間（35 塩基シングルリードの場合）で 実施できます。 各ステップごとに装置とハンズオンが必要です。

これまでの次世代 シーケンサー

ハンズ オン

DNA 増幅

ハンズ オン

DNA 増幅からシーケンス、データ解析が全自動

ハンズ オン

ハンズ オン

シーケンス

データ解析

サンプル調製

MiSeq

オプション データ保管、解析

サンプル調製

15 分のハンズオンでラン開始

ベースコール

サンプル調製：断片化装置 不要の 2 時間反応 *

試薬カートリッジで ランをスタート

MiSeq Reporter で 安心のデータ解析

酵 素 反 応 に よ り DNA 断 片 化 を 行 う

試薬キットはカートリッジ式になっていま

シ ス テ ム に 内 蔵 さ れ た Windows コ ン

Nextera テクノロジーでは、高額な断片化

す。調製したサンプルをアプライして準備

ピューターでは、 ベースコールとアライメン

装置を必要としません。断片化、 アダプター

は完了。フローセルと試薬カートリッジ、

トを行います。さらに MiSeq Reporter ソ

付加反応はシングルチューブで行うため、

廃液ボトルなどをセットした後は、タッチパ

フトウェアでは、ベースコール、アライメン

DNA のロスも少なくわずか 50ng の DNA

ネルでランを開始すると自動でデータ解析

ト、アプリケーションに応じた解析を行い

からスタートできます。

まで行います。

ます。

* TruSeq サンプル調製キットの場合は断片化装置が必要

トランスポソーム

ゲノムDNA

です。

～ 300bp タグメンテーション ～ 300bp

P5 Index 1

Read 1 Sequencing Primer Read 2 Sequencing Primer

Index 2 P7

PCR増幅 p5

Index1 Rd1 SP

Rd2 SP Index2

シーケンス解析用ライブラリー

p7

Nextera のワークフロー

MiSeq Reporter の一例 Resequencing

Small RNA

de novo Assembly

Amplicon

16S Metagenome

QC Library

世界シェア No.1 の実績とテクノロジー これまで国内外の多くのプロジェクトで採用されてきたイルミナの

1 塩基合成反応（SBS:Sequence by Synthesis）はホモポリマー

■L社

3,865 5%

■R社

配列も高精度な読み取りが可能です。 6,000 以上の研究論文に貢

9,520 13%

献し、公的データベースにも圧倒的な登録数を誇るイルミナのテク ノロジーから、数多くの次世代シーケンサー手法が確立されました。 グラフ：国際データベースのデスクトップ型次世代シーケンサー データ登録数（2014 年 12 月現在 http://sra.dbcls.jp）

■ イルミナ MiSeq 61,083 82%

多彩なアプリケーションを迅速、高精度に解析 16S メタゲノム解析 96 サンプル同時ラン

20 株の大腸菌 de novo アセンブル

FFPE 癌サンプルから KRAS 第 2 エクソンを解析

16S 超可変 V4 領域（254bp）を増幅

大腸菌 MG1665 を解析（150bp x2）

胃および直腸癌由来 FFPE サンプルか

し、96 サンプルを 1 ラン（150bp x2）

し、de novo アセンブル。コンティグ

ら、KRAS 第２エクソンを増幅して解析

で解析。イヌ、イヌの飼主（ヒト）から

最 大 長 は 311Kb、N50 は 148Kb と

（75bp x2）。直腸癌にて 27.5% の頻

のサンプルは、フリーソフトウェアパッ

良好な結果が得られました。ランあた

度で C から G へ塩基変異があること

ケージの QIIME を使用して門レベル

り 20 サンプルの解析が可能です。

がわかり、この変異は正常サンプルで

の分類が行われました。

も 1.1% で観察されました。 リファレンスコール（総数の%）

100 90

発現の比率 （16S rRNA遺伝子配列の割合）

80 70 60 50 40 30 20 10 0 イヌ

イヌの飼主（ヒト）

土壌

Crenarchaeota

Nitrospirae

Euryarchaeota

OP3

AD3

Planctomycetes

Acidobacteria

Proteobacteria

Actinobacteria

SC3

Armatimonadetes

SC4

BRC1

SM2F11

Bacteroidetes

SPAM

CCM11b

SR1

Chlamydiae

Spirochaetes

Chlorobi

Synergistetes

Chloroflexi

TM6

Cyanobacteria

TM7

Elusimicrobia

Tenericutes

Firmicutes

Thermi

Fusobacteria

Verrucomicrobia

GAL15

WPS-2

Gemmatimonadetes

WS3

Lentisphaerae

変異コール（総数の%）

100

80

60

40

変異 27.5%

20 変異 1.1% 0 NA18507

コントロール

QIIME を用いた門レベルでの分類

大腸菌アセンブルの結果を Circos で表示

一足先をゆくクラウドソリューション クラウドサービスの BaseSpace はシーケンスデータの保管と解析アプリを 提供します。1TB まで無償で利用可能なため、 MiSeq データも約 200 ラン 分 * の保管が可能です。また、BaseSpace ではサードパーティが開発した 解析アプリを自由に組み合わせデータの解析と可視化を行え、共同研究者 とのデータ共有も安全かつ効率的に行うことができます。 * 150bp x2, PhiX サンプルのランの場合を想定しています。

直腸癌

直腸正常

3 サンプルにおける変異の割合

ブレイクスルーのパフォーマンスと価格 製品仕様 サイズ

： 幅 × 奥行き × 高さ：68.6cm × 52.3cm × 56.5cm、重量：54.5kg

所要電源

： 100V AC、50/60Hz、10A、400W

内蔵コンピューター ： Windows 7 標準、750GB ハードドライブ、16GB RAM コンピューターの仕様は定期的に更新されます。最新の構成についてはお問い合わせください。 動作環境

： 温度 22℃ ± 3℃、湿度 20-80%（結露なきこと） 、高度 2,000m 未満、汚染度評価 2

検出

： 発光ダイオード 530nm、660nm

パフォーマンス *

MiSeq v2 試薬キット MiSeq v3 試薬キット

リード長

リード数

データ量

36bp x1 150bp x2 250bp x2 75bp x2 300bp x2

1200 ∼ 1500 万 2400 ∼ 3000 万 2400 ∼ 3000 万 4400 ∼ 5000 万 4400 ∼ 5000 万

540 ∼ 610Mb 4.5 ∼ 5.1Gb 7.5 ∼ 8.5Gb 3.3 ∼ 3.8Gb 13.2 ∼ 15Gb

DNA 増幅からシーケンス までの時間 ** ∼ 4 時間 ∼ 24 時間 ∼ 39 時間 ∼ 20 時間 ∼ 55 時間

Q30 以上の塩基 90％以上 80％以上 70％以上 85％以上 70％以上

* イルミナ PhiX ライブラリーを使用し、サポート内のパスフィルターのクラスター密度（MiSeq v2 試薬キットの場合は 467-583k/mm2、MiSeq v3 試薬キットの場合は 727-827k/mm2）で 実施します。実際の数値はサンプルに依存することがあります。 Q30 以上の塩基の割合は、そのラン全体の平均値です。 ** 調製済みライブラリーからシーケンスまでの合計時間です。

システム価格 カタログ番号

MS-J-001 SV-420-1002

製品名

希望販売価格（円）

MiSeq システム（DNA 増幅、シーケンサー、データ解析コンピューター内蔵） MiSeq 年間保守契約 Basic

16,500,000 2,150,000

試薬消耗品価格 カタログ番号 製品名 シーケンスラン試薬キット（ランに必要なフローセル、試薬カートリッジ、ボトルを含みます）

サンプルあたり

希望販売価格（円）

毒物 約 2500 万クラスター（3.75Gb） MiSeq Reagent Kit v3 (150 Cycles) 毒物 約 2500 万クラスター（15Gb） MiSeq Reagent Kit v3 (600 Cycles) 毒物 約 1500 万クラスター（750Mb） MiSeq Reagent Kit v2 (50 Cycles) 毒物 約 1500 万クラスター（4.5Gb） MiSeq Reagent Kit v2 (300 Cycles) 毒物 約 1500 万クラスター（7.5Gb） MiSeq Reagent Kit v2 (500 Cycles) 毒物 約 400 万クラスター（1.2Gb） MiSeq Reagent Micro Kit v2 (300 Cycle) 毒物 約 100 万クラスター（300Mb） MiSeq Reagent Nano Kit v2 (300 Cycle) 毒物 約 100 万クラスター（500Mb） MiSeq Reagent Nano Kit v2 (500 Cycle) サンプル調製キット（その他、Small RNA、RNA-Seq、ChIP-Seq キットもご用意しています） FC-121-1030 Nextera DNA Sample Prep Kit (24 Samples) 15,250 FC-121-1011 Nextera Index Kit (24 Indices, 96 Samples) 488 毒物 FC-131-1024 Nextera XT DNA Sample Prep Kit (24 Samples) 6,083 FC-131-1001 Nextera XT Index Kit (24 Indices, 96 Samples) 488

MS-102-3001 MS-102-3003 MS-102-2001 MS-102-2002 MS-102-2003 MS-103-1002 MS-103-1001 MS-103-1003

Nextera シリーズはそれぞれ対応する Index Kit とあわせてお使いください。

代理店

〒108-0014 東京都港区芝 5-36-7 三田ベルジュ 22 階 Tel (03) 4578-2800 Fax (03) 4578-2810 www.illuminakk.co.jp www.facebook.com/illuminakk 本製品の使用目的は研究に限定されます。 販売条件：www.illuminakk.co.jp/tc © 2015 Illumina, Inc. All rights reserved. llumina, IlluminaDx, BaseSpace, BeadArray, BeadXpress, cBot, CSPro, DASL, Design Studio, GAIIx, Genetic Energy, Genome Analyzer, GenomeStudio, GoldenGate, HiScan, HiSeq, Infinium, iSelect, MiSeq, Nextera, NextSeq, NuPCR, SeqMonitor, Solexa, TruSeq, TruSight, VeraCode, the pumpkin orange color, the Genetic Energy streaming bases design は、Illumina, Inc. の商標または登録商標です。 その他の会社名や商品名は、各社の商標または登録商標です。予告なしに仕様および価格を変更する場合があります。

Pub. No. MiSeq カタログ 01JAN2015

366,000 46,800 146,000 46,800

価格に消費税は含まれません。 ※ 2015 年 1 月 1 日現在の価格です。

毒物 このマークの製品には毒物および劇物取締法にて指定されている毒物が含まれます。

イルミナ株式会社

149,000 260,000 135,000 173,000 192,000 144,000 95,400 116,000